普通皖鱼与黑皖鱼的区别是：1、皖鱼是指草鱼，黑皖鱼指青鱼；2、体型不同：皖鱼亚圆筒形，体长大1m余，黑皖鱼体亚圆筒形，青黑色，鳍灰黑色；3、习性不同：皖鱼喜食幼虫、藻类、蚯蚓、蜻蜓等，黑皖鱼喜食螺蛳肉、蚬、蚌、虾、蜻蜓、幼虫、水虫等。
关于皖鱼
皖鱼是鲤科、草鱼属鱼类。草鱼的俗称有：鲩、油鲩、草鲩、鲩鱼、白鲩、草根(东北)等。体长为体高的3.4～4.0倍，为头长的3.6～4.3倍，为尾柄长的7.3～9.5倍，为尾柄高的6.8～8.8倍。
体长形，吻略钝，下咽齿2行，呈梳形。背鳍无硬刺，外缘平直，位于腹鳍的上方，起点至尾鳍基的距离较至吻端为近。鳃耙短小，数少。体呈茶黄色，腹部灰白色，体侧鳞片边缘灰黑色，胸鳍、腹鳍灰黄色，其它鳍浅色。
关于黑皖鱼
黑皖鱼是鲤科、青鱼属鱼类。体长可达145厘米。体长为体高的3.3～4.1倍，为头长的3.5～4.4倍，体粗壮，近圆筒形，腹部圆，无腹棱。背鳍位于腹鳍的上方，无硬刺，外缘平直。体呈青灰色，背部较深，腹部灰白色，鳍均呈黑色。个体大，最大可达70余千克。