宅基地登记面积与实际不符应按照宅基地登记面积进行确权。如果小于登记面积您可以重新申请宅基地。如果是实际面积大于宅基地面积，那么一般情况下大于的面积应按照违建处理。
(1)协商解决
《土地管理法》第16条第1款规定：”土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。“据此规定，公民之间发生的宅基地纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。
(2)行政解决
《土地管理法》第16条第2款规定：”个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。“该法还规定，侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。
(3)司法解决
《土地管理法》第16条第3款规定：当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。这表明公民之间就土地的使用权和所有权发生的纠纷，只与按照《土地管理法》第16条和第53条的规定，先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。否则，人民法院不予受理。但对于侵犯土地的所有权或者使用权的，被侵权人可以不经行政机关的处理，而直接向人民法院起诉。
农村宅基地确权超出面积
在进行宅基地确权的时候，宅基地和房屋的面积的测量是一项很重要的工作，但很多家庭也会遇到测量与登记面积不一致的问题，那么这种情况该如何处理呢？首先得弄清楚造成面积不一致的原因所在，一般大致可分为两种情况，一是由于测量方法不同，造成宅基地面积不一致；二是由于存在少数私自占地的，导致宅基地面积不一致。
法律依据：《中华人民共和国农村土地承包法》第四十九条以其他方式承包农村土地的，应当签订承包合同，承包方取得土地经营权。当事人的权利和义务、承包期限等，由双方协商确定。以招标、拍卖方式承包的，承包费通过公开竞标、竞价确定；以公开协商等方式承包的，承包费由双方议定。第五十五条因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解解决。当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。
因篇幅问题不能全部显示，请点此查看更多更全内容